バイオインフォマティクス |京大新刊情報ポータル

バイオインフォマティクス

Pythonによる実践レシピ

翻訳

情報

Tiago Antao [著], 阿久津達也, 竹本和広訳

阿久津達也(化学研究所 / 翻訳)

Tatsuya Akutsu (化学研究所, 翻訳)

Pythonを中心とするツール群の活用例を具体的なレシピ約50で紹介。目の前の研究に活かせる。環境構築から丁寧に解説。〔内容〕次世代シークエンス／ゲノム解析／集団遺伝学／系統学／タンパク質／データ公開・共有／ビッグデータ／他

〇本書で学べること
・次世代シーケンス（NGS）データ解析の進め方
・FASTQ, BAM, VCFフォーマットのデータの取扱い
・Galaxyへのアクセス
・Dask, Sparkなどを活用した大規模データ処理
・Cytoscapeによる可視化
・主成分分析，決定木分析など機械学習の活用